2013年，上海交通大学海洋研究院成立。2018年10月，上海交通大学与自然资源部第二海洋研究所强强联合，在海洋研究院的基础上合作共建海洋学院。2021年，海洋学院被教育部与自然资源部认定为全国首批科教融合共建平台，同年6月，上海交通大学与中国极地研究中心(中国极地研究所)签署合作共建协议。
海洋学院积极发挥部部共建优势，围绕“大海洋”发展战略，实现海洋科学与技术交叉融合发展。学院目前拥有海洋科学本科专业、海洋科学一级学科硕士点和博士点、海洋科学博士后科研流动站，建设了海洋科学与技术交叉融合的国际化一流人才培养体系，旨在培养科学基础扎实，人文素养深厚、兴趣驱动多学科协调发展的海洋学科领军人才。自2021年上海交通大学海洋科学学科在泰晤士高等教育2023年度中国学科评级(理学)中蝉联A或A+。
海洋学院将于2024年7月9日-12日，举办“上海交通大学海洋学九游体育官方平台院2025年研究生优才夏令营”。本次夏令营旨在汇聚全国各地优秀学子，提供交流平台，增进对上海交大海洋学院的认识，并进行2025年度推荐免试研究生的预选拔。欢迎全国各地优秀学子报名参与!活动拟安排如下(拟定安排，详请关注后续通知)：
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